Вот несколько советов, которые помогут вам сократить время разработки и время поиска исходных кодов:
1) Устанавливайте модули и скрипты на сайт только в соответствующую папку скрипту папку, ведь иначе вам придется тратить много времени на вычленение и удаление скрипта из разных мест сайта.
2) Всегда пишите track-list изменений которые вы вносили в сайт. Иначе вы забудете что и как делали.
3) Всегда указывайте в track-list-е следующую информацию: [Дата], [имя фамилия, того кто делал изменения], [что было сделано], [где были произведены изменения - путь до файлов]
4) Если вы используете стороннюю CMS для ваших проектов, всегда делайте back-up-ы сайта (файлов и MySQL) ведь сторонний модуль при своем запуске может порушить структуру базы данных и восстановить ее вам уже так просто не удастся.
5) Всегда сортируйте скрипты не по названию, а по своему функционалу, даже если для этого придется создавать более 5и под-папок.
6) Не сохраняйте материал из интернета в общую папку а сразу сортируйте его, ведь иначе вы никогда не найдете время на его последующую сортировку.
7) Не жалейте сейчас время на то, что в дальнейшем вам его сохранит.